Die Pflanzenwurzel ist ein komplexes Organ mit verschiedenen spezialisierten Zonen und Funktionen.
Der Aufbau der Wurzel lässt sich in mehrere wichtige Bereiche unterteilen. Im Zentralzylinder befinden sich die Leitungsbahnen für Wasser und Nährstoffe. Die Wurzelrinde umgibt den Zentralzylinder und dient dem Stofftransport sowie der Speicherung. Besonders wichtig sind die Wurzelhaare in der Differenzierungszone, die die Oberfläche zur Aufnahme von Wasser und Mineralstoffen stark vergrößern. Die Endodermis fungiert als wichtige Kontrollschicht zwischen Rinde und Zentralzylinder.
Bei der Ernährung der Pflanze unterscheidet man zwischen autotropher und heterotropher Assimilation. Während bei der autotrophen Assimilation durch Photosynthese aus anorganischen Stoffen organische Verbindungen aufgebaut werden, nehmen heterotrophe Organismen bereits fertige organische Verbindungen auf. Dies ist ein wichtiger Aspekt des Stoff- und Energiewechsels. Die biotischen Faktoren wie andere Organismen und die abiotischen Faktoren wie Licht, Temperatur und Wasser beeinflussen dabei das Pflanzenwachstum maßgeblich. Die Sprossachse transportiert die aufgenommenen Stoffe in alle Pflanzenteile und sorgt für die aufrechte Haltung der Pflanze. Ihr Aufbau ist durch verschiedene Gewebetypen gekennzeichnet, die jeweils spezifische Funktionen erfüllen. Die Stoff- und Energieumwandlung findet kontinuierlich in allen Pflanzenzellen statt und ermöglicht Wachstum, Entwicklung und Anpassung an Umweltbedingungen.