Aminosäuresequenz-Vergleich am Beispiel von Cytochrom c
Der Vergleich von Aminosäuresequenzen, hier am Beispiel des Enzyms Cytochrom c, ist eine moderne Methode der Verwandtschaftsbestimmung in der Molekularbiologie.
Cytochrom c ist ein wichtiges Enzym der Atmungskette Zellatmung und eignet sich gut für Verwandtschaftsanalysen, da es bei allen Arten vorkommt.
Bei der Analyse werden die Aminosäuresequenzen verschiedener Arten hier:Mensch,Rhesusaffe,Pferd,Rind verglichen und Unterschiede markiert.
Example: An Position 11 hat der Mensch die Aminosäure Isoleucin I, während das Pferd hier Valin V aufweist.
Die Auswertung der Unterschiede ermöglicht Rückschlüsse auf die Verwandtschaftsverhältnisse:
- Rhesusaffe: Sehr ähnliche Sequenz zum Menschen
- Pferd und Rind: Mehr Unterschiede, aber untereinander ähnlicher
Diese Ergebnisse stimmen mit denen des Präzipitin-Tests überein und bestätigen die Verwandtschaftsverhältnisse.
Highlight: Die Verteilung der Mutationen über die Sequenz ist nicht zufällig. Manche Positionen sind stärker konserviert als andere, was auf ihre funktionelle Bedeutung für das Enzym hindeutet.
Vocabulary: Konservierte Bereiche sind Abschnitte einer Aminosäuresequenz, die im Laufe der Evolution wenig Veränderungen erfahren haben, da sie für die Funktion des Proteins besonders wichtig sind.
TCAGCTGTACG